Efficient computation of free energy of crystal phases due to external potentials by error-biased Bennett acceptance ratio method
نویسندگان
چکیده
منابع مشابه
Computation of the linear Schrodinger Energy levels by Sinc method
Computation of the Schrodinger equation energy levels is very important in physics. For example we can use these levels to calculate the absorption coefficient and light refraction in a material as well as calculation of the interband and intersubband transition energies. Density of states of the system can also be obtained by using the energy levels. Thereafter we can determine that the system...
متن کاملthe role of russia in transmission of energy from central asia and caucuses to european union
پس ازفروپاشی شوروی،رشد منابع نفت و گاز، آسیای میانه و قفقاز را در یک بازی ژئوپلتیکی انرژی قرار داده است. با در نظر گرفتن این منابع هیدروکربنی، این منطقه به یک میدانجنگ و رقابت تجاری برای بازی های ژئوپلتیکی قدرت های بزرگ جهانی تبدیل شده است. روسیه منطقه را به عنوان حیات خلوت خود تلقی نموده و علاقمند به حفظ حضورش می باشد تا همانند گذشته گاز طبیعی را به وسیله خط لوله مرکزی دریافت و به عنوان یک واس...
15 صفحه اولComparison of efficiency and bias of free energies computed by exponential averaging, the Bennett acceptance ratio, and thermodynamic integration.
Recent work has demonstrated the Bennett acceptance ratio method is the best asymptotically unbiased method for determining the equilibrium free energy between two end states given work distributions collected from either equilibrium and nonequilibrium data. However, it is still not clear what the practical advantage of this acceptance ratio method is over other common methods in atomistic simu...
متن کاملComputation of Hemagglutinin Free Energy Difference by the Confinement Method
Hemagglutinin (HA) mediates membrane fusion, a crucial step during influenza virus cell entry. How many HAs are needed for this process is still subject to debate. To aid in this discussion, the confinement free energy method was used to calculate the conformational free energy difference between the extended intermediate and postfusion state of HA. Special care was taken to comply with the gen...
متن کاملsolution of security constrained unit commitment problem by a new multi-objective optimization method
چکیده-پخش بار بهینه به عنوان یکی از ابزار زیر بنایی برای تحلیل سیستم های قدرت پیچیده ،برای مدت طولانی مورد بررسی قرار گرفته است.پخش بار بهینه توابع هدف یک سیستم قدرت از جمله تابع هزینه سوخت ،آلودگی ،تلفات را بهینه می کند،و هم زمان قیود سیستم قدرت را نیز برآورده می کند.در کلی ترین حالتopf یک مساله بهینه سازی غیر خطی ،غیر محدب،مقیاس بزرگ،و ایستا می باشد که می تواند شامل متغیرهای کنترلی پیوسته و گ...
ذخیره در منابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ژورنال
عنوان ژورنال: The Journal of Chemical Physics
سال: 2010
ISSN: 0021-9606,1089-7690
DOI: 10.1063/1.3308622